De organisatie van de Brabantsedag kent als bestuursorganen: Het Bestuur van de Stichting Brabantsedag en de Commissie van Aanbeveling van de Stichting Brabantsedag.

Het Bestuur van de Stichting Brabantsedag wordt gevormd door de voorzitter, secretaris, penningmeester en acht leden. Naast de algemene bestuurstaken is elk lid verantwoordelijk voor een of meerdere specifieke activiteiten en programmaonderdelen van de Brabantsedag, veelal gecoördineerd vanuit werkgroepen en commissies.

Het Bestuur van de Stichting Brabantsedag beschikt ove een permanent bezet bureau, het secretariaat, noodzakelijk om gedurende het jaar bestuursbesluiten uit te voeren, vergaderingen voor te bereiden, contacten te leggen en correspondentie te verzorgen behorend bij een dergelijk omvangrijk evenement.